MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 72355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022579	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022579	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022579	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022579	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022579	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022579	AT	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022579	A	7	7	313	319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022579	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022579	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593594
11	NC_022579	A	7	7	381	387	100 %	0 %	0 %	0 %	551593594
12	NC_022579	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
13	NC_022579	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	551593595
14	NC_022579	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
15	NC_022579	AAAG	2	8	539	546	75 %	0 %	25 %	0 %	551593595
16	NC_022579	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	551593595
17	NC_022579	GCAG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	551593595
18	NC_022579	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	551593595
19	NC_022579	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593595
20	NC_022579	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
21	NC_022579	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	551593595
22	NC_022579	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022579	TA	3	6	774	779	50 %	50 %	0 %	0 %	551593596
24	NC_022579	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
25	NC_022579	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
26	NC_022579	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
27	NC_022579	A	8	8	1182	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	551593596
28	NC_022579	A	6	6	1238	1243	100 %	0 %	0 %	0 %	551593596
29	NC_022579	G	6	6	1308	1313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022579	CA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022579	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022579	CT	3	6	1475	1480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022579	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022579	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022579	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593597
36	NC_022579	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
37	NC_022579	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
38	NC_022579	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593597
39	NC_022579	GT	3	6	1733	1738	0 %	50 %	50 %	0 %	551593597
40	NC_022579	T	7	7	1738	1744	0 %	100 %	0 %	0 %	551593597
41	NC_022579	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	551593597
42	NC_022579	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593597
43	NC_022579	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593597
44	NC_022579	C	9	9	1954	1962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_022579	T	8	8	1964	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022579	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022579	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022579	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022579	G	6	6	2114	2119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022579	T	6	6	2211	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022579	T	6	6	2286	2291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022579	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022579	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022579	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022579	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022579	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022579	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022579	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022579	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022579	TTAA	2	8	2621	2628	50 %	50 %	0 %	0 %	551593598
61	NC_022579	A	6	6	2635	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	551593598
62	NC_022579	TAGG	2	8	2652	2659	25 %	25 %	50 %	0 %	551593598
63	NC_022579	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022579	GA	3	6	2813	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022579	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	551593599
66	NC_022579	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593599
67	NC_022579	TCCA	2	8	2916	2923	25 %	25 %	0 %	50 %	551593599
68	NC_022579	GTTA	2	8	2929	2936	25 %	50 %	25 %	0 %	551593599
69	NC_022579	TTCA	2	8	2958	2965	25 %	50 %	0 %	25 %	551593599
70	NC_022579	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
71	NC_022579	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
72	NC_022579	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
73	NC_022579	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593600
74	NC_022579	A	7	7	3181	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
75	NC_022579	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593600
76	NC_022579	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
77	NC_022579	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
78	NC_022579	GAAA	2	8	3468	3475	75 %	0 %	25 %	0 %	551593600
79	NC_022579	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
80	NC_022579	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
81	NC_022579	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
82	NC_022579	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
83	NC_022579	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
84	NC_022579	A	7	7	3863	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
85	NC_022579	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
86	NC_022579	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
87	NC_022579	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593600
88	NC_022579	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	551593600
89	NC_022579	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
90	NC_022579	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593600
91	NC_022579	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
92	NC_022579	GAAT	2	8	4338	4345	50 %	25 %	25 %	0 %	551593600
93	NC_022579	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
94	NC_022579	A	6	6	4473	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
95	NC_022579	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
96	NC_022579	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
97	NC_022579	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
98	NC_022579	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
99	NC_022579	CCAA	2	8	4803	4810	50 %	0 %	0 %	50 %	551593600
100	NC_022579	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
101	NC_022579	T	6	6	4858	4863	0 %	100 %	0 %	0 %	551593600
102	NC_022579	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
103	NC_022579	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	551593600
104	NC_022579	TGTC	2	8	5047	5054	0 %	50 %	25 %	25 %	551593600
105	NC_022579	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
106	NC_022579	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
107	NC_022579	ATTT	2	8	5203	5210	25 %	75 %	0 %	0 %	551593600
108	NC_022579	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
109	NC_022579	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
110	NC_022579	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
111	NC_022579	AG	3	6	5407	5412	50 %	0 %	50 %	0 %	551593600
112	NC_022579	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
113	NC_022579	AC	3	6	5504	5509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022579	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593601
115	NC_022579	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593601
116	NC_022579	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
117	NC_022579	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593601
118	NC_022579	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
119	NC_022579	CTTT	2	8	6000	6007	0 %	75 %	0 %	25 %	551593601
120	NC_022579	CTTT	2	8	6017	6024	0 %	75 %	0 %	25 %	551593601
121	NC_022579	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593601
122	NC_022579	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593601
123	NC_022579	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	551593601
124	NC_022579	T	6	6	6142	6147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022579	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022579	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022579	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022579	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
129	NC_022579	T	7	7	6314	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	551593602
130	NC_022579	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593602
131	NC_022579	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
132	NC_022579	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	551593602
133	NC_022579	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	551593602
134	NC_022579	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
135	NC_022579	TCTG	2	8	6730	6737	0 %	50 %	25 %	25 %	551593602
136	NC_022579	GGAT	2	8	6837	6844	25 %	25 %	50 %	0 %	551593602
137	NC_022579	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593602
138	NC_022579	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
139	NC_022579	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
140	NC_022579	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	551593602
141	NC_022579	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
142	NC_022579	GAAC	2	8	7223	7230	50 %	0 %	25 %	25 %	551593603
143	NC_022579	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593603
144	NC_022579	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593603
145	NC_022579	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593603
146	NC_022579	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593603
147	NC_022579	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593603
148	NC_022579	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593603
149	NC_022579	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	551593603
150	NC_022579	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593603
151	NC_022579	GCAA	2	8	7647	7654	50 %	0 %	25 %	25 %	551593604
152	NC_022579	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
153	NC_022579	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593604
154	NC_022579	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593604
155	NC_022579	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593604
156	NC_022579	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	551593604
157	NC_022579	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
158	NC_022579	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	551593604
159	NC_022579	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593604
160	NC_022579	T	6	6	8231	8236	0 %	100 %	0 %	0 %	551593604
161	NC_022579	T	6	6	8330	8335	0 %	100 %	0 %	0 %	551593604
162	NC_022579	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593604
163	NC_022579	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022579	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_022579	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_022579	A	8	8	8563	8570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022579	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022579	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_022579	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022579	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022579	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_022579	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022579	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022579	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	551593605
175	NC_022579	ACTC	2	8	8956	8963	25 %	25 %	0 %	50 %	551593605
176	NC_022579	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593605
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179	NC_022579	ACTT	2	8	9097	9104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_022579	T	6	6	9103	9108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_022579	TGTT	2	8	9203	9210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_022579	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_022579	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593606
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228	NC_022579	A	7	7	11235	11241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_022579	T	7	7	11288	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_022579	AATA	2	8	11308	11315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_022579	AT	3	6	11333	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_022579	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_022579	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_022579	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_022579	A	6	6	11442	11447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_022579	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_022579	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
238	NC_022579	TCCC	2	8	11501	11508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
239	NC_022579	T	6	6	11572	11577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_022579	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_022579	A	6	6	12045	12050	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
250	NC_022579	GACA	2	8	12051	12058	50 %	0 %	25 %	25 %	551593610
251	NC_022579	A	6	6	12342	12347	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
252	NC_022579	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
253	NC_022579	ATTG	2	8	12462	12469	25 %	50 %	25 %	0 %	551593610
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255	NC_022579	ATA	2	6	12586	12591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593610
256	NC_022579	AAGG	2	8	12618	12625	50 %	0 %	50 %	0 %	551593610
257	NC_022579	ACG	2	6	12659	12664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593610
258	NC_022579	GAT	2	6	12842	12847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593610
259	NC_022579	AAG	2	6	13011	13016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593611
260	NC_022579	AAG	2	6	13143	13148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593611
261	NC_022579	ATG	3	9	13201	13209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593611
262	NC_022579	A	6	6	13230	13235	100 %	0 %	0 %	0 %	551593611
263	NC_022579	TTC	2	6	13263	13268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593611
264	NC_022579	CTT	2	6	13271	13276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593611
265	NC_022579	CAT	2	6	13293	13298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593611
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267	NC_022579	TTG	2	6	13369	13374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593611
268	NC_022579	AATA	2	8	13471	13478	75 %	25 %	0 %	0 %	551593611
269	NC_022579	A	7	7	13478	13484	100 %	0 %	0 %	0 %	551593611
270	NC_022579	AAG	2	6	13581	13586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593611
271	NC_022579	T	6	6	13605	13610	0 %	100 %	0 %	0 %	551593611
272	NC_022579	AATA	2	8	13635	13642	75 %	25 %	0 %	0 %	551593611
273	NC_022579	AAGTG	2	10	13664	13673	40 %	20 %	40 %	0 %	551593612
274	NC_022579	GTG	2	6	13714	13719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593612
275	NC_022579	GATA	2	8	13804	13811	50 %	25 %	25 %	0 %	551593612
276	NC_022579	CTG	2	6	13851	13856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593613
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278	NC_022579	GATA	2	8	13903	13910	50 %	25 %	25 %	0 %	551593613
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407	NC_022579	T	7	7	20139	20145	0 %	100 %	0 %	0 %	551593620
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498	NC_022579	T	6	6	24906	24911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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